Publications of H.S.Lopes

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2018:

Journal papers:

  1. Ribeiro, M., Lazzaretti, A.E., Lopes, H.S., A study of deep convolutional auto-encoders for anomaly detection in videos. Pattern Recognition Letters, v. 68, n. 2, p. 250-259, 2018.  

Lecture Notes in Computer Science:

  1. Gutoski, M., Ribeiro, M., Aquino, N.M.R., Hattori, L.T., Lazzaretti, A.E., Lopes, H.S. Feature Selection Using Differential Evolution for Unsupervised Image Clustering In: Proc. of the International Conference on Artificial Intelligence and Soft Computing, 2018.  In:  Rutkowski L., Scherer R., Korytkowski M., Pedrycz W., Tadeusiewicz R., Zurada J. (eds) Artificial Intelligence and Soft Computing. ICAISC 2018. Lecture Notes in Computer Science, vol 10841. Springer, Cham, p. 376-385, 2018.

Conferences:

  1. Hattori, L.T., Benítez, C.M.V., Gutoski, M., Aquino, N.M.R., Lopes, H.S.  A Novel Approach to Protein Folding Prediction based on Long Short-Term Memory Networks: A Preliminary Investigation and Analysis. In: Proc. of IEEE World Congress on Computational Intelligence, Rio de Janeiro, 2018.

  2. Silveira, T.B.N., Lopes, H. S., Lazzaretti, A.E., Araújo, D.P., Valério, C.F., Classificação de contexto para processamento da linguagem natural baseado em representação vetorial de palavras e no agrupamento por k-means. In: Proc. Computer on the Beach, Florianópolis, SC: UNIVALI, p. 502-510, 2018.
     

 


2017:

Journal papers:

Edited Books:

  1. Nedjah, N., Mourelle, L.M., Lopes, H.S. (Eds.), Designing with Computational Intelligence. 1st ed. Berlin: Springer, 238p, 2017. ISBN: 978331944734-6

  2. Nedjah, N., Mourelle, L.M., Lopes, H.S. (Eds.), Evolutionary Multi-Objective System Design: Theory and Applications. 1st. ed. Boca Raton, FL: Chapman and Hall/CRC, 233p, 2017. ISBN:  978149878028-5

Conferences:

  1. Gutoski, M., Ribeiro, M., Aquino, N.M.R., Lazzaretti, A.E., Lopes, H.S., A Clustering-Based Deep Autoencoder for One-Class Image Classification. In: Proc. 4th IEEE Latin American Conference on Computational Intelligence LA-CCI, Arequipa, Peru, Piscataway, NJ: IEEE Press, 2017.  

  2. Hattori, L.T., Benítez, C.M.V., Lopes, H.S., A Deep Bidirectional Long Short-Term Memory Approach Applied to the Protein Secondary Structure Prediction Problem. In: Proc. 4th IEEE Latin American Conference on Computational Intelligence LA-CCI,  Arequipa, Peru, Piscataway, NJ: IEEE Press, 2017.  

  3. Aquino, N.M.R., Ribeiro, M., Gutoski, M., Benítez, C.V., Lopes, H.S., A Gene Expression Programming Approach for Evolving Multi-Class Image Classifiers. In: Proc. 4th IEEE Latin American Conference on Computational Intelligence LA-CCI, 2017, Arequipa, Peru, Piscataway, NJ: IEEE Press, 2017. 

  4. Gutoski, M., Aquino, N.M.R., Ribeiro, M. Lazzaretti, A.E., Lopes, H.S., Detection of Video Anomalies Using Convolutional Autoencoders and One-Class Support Vector Machines. In: Proc. XIII Brazilian Congress on Computational Intelligence, Niterói, RJ, 2017.

  5. Hattori, L.T., Gutoski, M., Aquino, N.M.R., Lopes, H.S., Patch-Based Convolutional Neural Network for the Writer Classification Problem in Music Score Images. In: Proc. XIII Brazilian Congress on Computational Intelligence, Niterói, RJ, 2017.

  6. Aquino, N.M.R., Gutoski, M., Hattori, L.T., Lopes, H.S., Soft Biometrics Classification Using Denoising Convolutional Autoencoders and Support Vector Machines. In: Proc. XIII Brazilian Congress on Computational Intelligence, Niterói, RJ, 2017.

  7. Aquino, N.M.R., Gutoski, M., Hattori, L.T., Lopes, H.S., The effect of data augmentation on the performance of convolutional neural networks. In: Proc. XIII Brazilian Congress on Computational Intelligence, Niterói, RJ, 2017.

  8. Aquino, N.M.R., Seca Neto, A.G.S., Lopes, H.S., A Study on the Perception of Researchers about the Application of Agile Software Development Methods in Research. Proceedings of Agile Brazil'2017, Belém, PA, 2017


2016:

Journal papers:

  1. Hattori, L.T., Lopes, H.S., Lopes, F.M., Evolutionary computation and swarm intelligence for the inference of gene regulatory networks. International Journal of Innovative Computing and Applications, v. 7, p. 225-235, 2016.  

  2. Negri, L.H., Lopes, H.S., Muller, M., Fabris, J.L., Paterno, A.S., A high performance approach for parallel computing of fibre Bragg grating strain profiles using graphics processing units. International Journal of High Performance Systems Architecture, v. 6, n.4, p. 197-204, 2016.  

  3. Krause, Jonas ; Lopes, H.S.,  Evolutionary computation methods for the schedule optimisation of pipeline networks. International Journal of Innovative Computing and Applications (Online), v. 7, p. 191-191-201, 2016.  

Conferences:

  1. Plichoski, G.F., Dorini, L., Lopes, H.S., Chidambaram, C., A cascade face recognigion approach with illumination compensation using local features. In: Proc. of Workshop on Computer Vision, p. 1-6, 2016. 


2015:

Journal papers:

  1. Parpinelli, R.S, Lopes, H.S. A computational ecosystem for optimization: review and perspectives for future research. Memetic Computing, v. 7, p. 29-41, 2015.

  2. Perlin, H.A., Lopes, H.S., Extracting human attributes using a convolutional neural network approach. Pattern Recognition Letters, v. 68, n. 2, p. 250-259, 2015.

  3. Nunes, L.F., Galvão, L.C., Lopes, H.S., Moscato, P., Berretta, R., An integer programming model for protein structure prediction using the 3D-HP side chain model. Discrete Applied Mathematics, v. 198, p. 2-6-214, 2015

Edited Books:

  1. Bastos Filho, C.J.A., Pozo, A.T.R., Lopes, H.S. (Org.)  Anais do 12. Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional. Curitiba, PR: ABRICOM, 2015. ISBN: 978-85-69972-00-6 (CD-ROM)

  2. Vellasco, M.M.B.R., Túpac, Y., Lopes, H.S.,  (Org.). Proceedings of 2015 Latin American Congress on Computational Intelligence (LA-CCI). Piscataway, NJ: IEEE, 2015. ISBN: 978-1-4673-8418-6

Book Chapters:

  1. Benítez, C.M.V., Weinert, W.R., Lopes, H.S. Gene Expression Programming for Evolving Two-Dimensional Cellular Automata in a Distributed Environment. In: D. Camacho; L. Braubach; S. Venticinque; C. Badica. (Ed.). Studies in Computational Intelligence. 1ed. Heidelberg: Springer International Publishing, 2015, v. 570, p. 107-117.

Conferences:

  1. Krause, J., Sieczka, E.L., Lopes, H.S., Differential evolution variants and MILP for the pipeline network schedule optimization problem. In: Proceedings of 2015 Latin America Congress on Computational Intelligence (LA-CCI).  Piscataway, NJ: IEEE Press, p. 1-6, 2015.

  2. Sikora, C.G.S., Lopes, T.C., Lopes, H.S., Magatão, L., Genetic algorithm for type-2 assembly line balancing. In: Proceedings of 2015 Latin America Congress on Computational Intelligence (LA-CCI).  Piscataway, NJ: IEEE Press, p. 1-6, 2015.

  3. Negri, L.H., Lopes, H.S., Muller, M., Fabris, J.L., Paterno, A.S., An efficient method to determine strain profiles on FBGs by using differential evolution and GPU. In: Proceedings of 2015 Latin America Congress on Computational Intelligence (LA-CCI).  Piscataway, NJ: IEEE Press, p. 1-6, 2015.

  4. Ribeiro, M., Lopes, H.S., Multi-class classification of objects in images using principal component analysis and genetic programming. In: Proceedings of 2015 Latin America Congress on Computational Intelligence (LA-CCI).  Piscataway, NJ: IEEE Press, p. 1-6, 2015.

  5. Hattori, L.T., Lopes, H.S., Lopes, F.M., A discretized differential evolution algorithm for the inference of Gene Regulatory Networks.  In: Proceedings of 2015 Latin America Congress on Computational Intelligence (LA-CCI).  Piscataway, NJ: IEEE Press, p. 1-6, 2015.

  6. Silva, R.R. da, Lima, C.R., Lopes, H.S., Um Novo Algoritmo Compacto Genético em Hardware: emCGA-HW. In: Anais do12. Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional, 2015, Curitiba. p. 1-5, 2015.


2014:

Journal papers:

  1. Scalabrin, M.H., Parpinelli, R.S., Benítez, C.V., Lopes, H.S., Population-based harmony search using GPU applied to protein structure prediction. International Journal of Computational Science and Engineering, v. 9, p. 106-118, 2014. ISSN online: 1742-7193  

  2. Parpinelli, R.S., Benítez, C.V.; Cordeiro, J.A.;  Lopes, H.S., Performance analysis of swarm intelligence algorithms for the 3D-AB off-lattice protein folding problem. International Journal of Multiple-Valued Logic and Soft Coputing, v. 22, p. 267-286, 2014. ISSN online: 1542-3999  

  3. Chidambaram, C., Vieira Neto, H., Dorini, L.E.B., Lopes, H.S., Multiple Face Recognition Using Local Features and Swarm Intelligence. IEICE Transactions on Information and Systems, v. E97.D, p. 1614-1623, 2014.

  4. Castilho, L.V., Lopes, H.S., Weinert, W.R., Andres, L.F. Desenvolvimento motor típico no primeiro ano: caracterização e detalhamento. Fisioterapia Ser, v. 9, p. 193-197, 2014.

Book Chapters:

  1. Barros, A.M., Lopes, H.S. Evolvable Hardware. In: Mehdi Khosrow-Pour. (Ed.). Encyclopedia of Information Science and Technology. 3ed. Hershey, PA: IGI Global, 2014, v. , p. 205-215.

  2. Gabardo, A.C., Lopes, H.S. Clustering Methods for Detecting Communities in Networks. In: Mehdi Khosrow-Pour. (Ed.). Encyclopedia of Information Science and Technology, Third Edition. 3ed. Hershey, PA: IGI Global, 2014, v. , p. 3507-3516. 

  3. Ribeiro, M., Lopes, H.S. Image Segmentation Methods. In: Mehdi Khosrow-Pour. (Ed.). Encyclopedia of Information Science and Technology. 3ed. Hershey, PA: IGI Global, 2014, v. , p. 1-11.

  4. Perlin, H.A., Chidambaram, C., Lopes, H.S. . Template Matching in Digital Images with Swarm Intelligence. In: Mehdi Khosrow-Pour. (Ed.). Encyclopedia of Information Science and Technology. 3ed. Hershey, PA: IGI Global, 2014, v. , p. 645-653.

Conferences:

  1. Gabardo, A.C., Lopes, H.S. Using Social Network Analysis to Unveil Cartels in Public Bids. In: Proc. European Network Intelligence Conference (ENIC), Wroclaw, Poland, p. 17-21,  2014.


2013:

Journal papers:

  1. Benítez, C.M.V.; Lopes, H.S., Ab-Initio Protein Folding Using Molecular Dynamics and a Simplified Off-Lattice Model. Journal of Bionanoscience, v. 7, p. 391-402, 2013.

Edited Books:

  1. Lopes, H.S.,  Rodrigues, L.C.A., Steiner, M.T.A. (Eds.), Meta-Heurísticas em Pesquisa Operacional. Curitiba: Omnipax, 2013. 482p .

Book Chapters:

  1. Krause, J., Cordeiro, J.A., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S.,  A Survey of swarm algorithms applied to discrete optimization problems. In: Xin-She Yang; Zhihua Cui; Renbin Xiao; Amir Hossein Gandomi; Mehmet Karamanoglu (Eds). Swarm Intelligence and Bio-Inspired Computation: Theory and Applications. Amsterdam: Elsevier Science, 2013, p. 169-192. ISBN: 9780124051638.  

  2. Krause, J., Cordeiro, J.A., Lopes, H.S., Comparação de métodos de computação evolucionária para o problema da mochila multidimensional. In: H.S. Lopes, L.C.A. Rodrigues, M.T.A. Steiner. (Eds), Meta-Heurísticas em Pesquisa Operacional. Curitiba: Omnipax, 2013, p. 87-98.

Conferences:

  1. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., An Ecology-Based Evolutionary Algorithm Applied to the 2D-AB Off-Lattice Protein Structure Prediction Problem. Proc. of Brazilian Conference on Intelligent Systems - BRACIS, IEEE Press, p. 64-69, 2013.

  2. Talau, M., Wille, E.C.G., Lopes, H.S., Solving the base placement problem by means of swarm intelligence. In: Proc. IEEE Symposium on Computational Intelligence for Communication Systems and Networks (CIComms), Symposium Series on Computational Intelligence, Singapore, p. 39-44 , 2013.

  3. Kalegari, D.H., Lopes, H.S., An improved parallel differential evolution  approach for protein structure prediction using both 2D and 3D off-lattice models. In: Proc. IEEE Symposium on Differential Evolution (SDE), Symposium Series on Computational Intelligence, Singapore, p.  143-150, 2013.

  4. Cabrita, D.M., Godoy Jr., W., Lopes, H.S., A fast modular simulator for combinational logic circuits generated by genetic algorithm. In: Proc. Conference on Evolutionary Computation, IEEE Press, Cancún, México, p. 2797 - 2801, 2013.

  5. Krause, J.; Lopes, H.S., A comparison of differential evolution algorithm with binary and continuous encoding for the MKP. In: Proceedings of BRICS - Conference on Computational Intelligence, 2013, Recife, 2013.

  6. Silva, R.; Lopes, H.S.; Godoy Jr., W., A heuristic algorithm based on ant colony optimization for multi-objective routing in vehicle ad hoc networks. In: Proceedings of BRICS - Conference on Computational Intelligence, 2013, Recife, 2013.

  7. Benítez, C.M.V.; Parpinelli, R.S.; Lopes, H.S., A heterogeneous parallel ecologically-inspired approach applied to the 3D-AB off-lattice protein structure prediction problem. In: Proceedings of BRICS - Conference on Computational Intelligence, 2013, Recife, 2013.

  8. Prosdóssimo, F.C. ; Chidambaram, C. ; Lopes, H. S., Eye detection approaches based on AdaBoost and SVM algorithms. In: Workshop em Visão Computacional, 2013, Rio de Janeiro. Anais do IX Workshop em Visão Computacional, 2013. p. 1-5.

  9. Chidambaram, C. ; Lopes, H. S. ; Vieira Neto, H., Global, semi-global and local color angular features for unsupervised face recognition. In: Workshop em Visão Computacional, 2013, Rio de Janeiro. Anais do IX Workshop em Visão Computacional, 2013. p. 1-6.

 

2012:

Journal papers:

  1. Parpinelli, Rafael S., Teodoro, Fábio R., Lopes, Heitor S., A comparison of swarm intelligence algorithms for structural engineering optimization. International Journal for Numerical Methods in Engineering, v. 91, p. 666-684, 2012.  ISSN: 1097-0207  

  2. Lopes, H.S., Król, D., Nature-inspired collective intelligence in theory and practice. Information Sciences, v. 182, p. IFC, 2012

  3. Benítez, C.V., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Parallelism, hybridism and coevolution in a multi-level ABC-GA approach for the protein structure prediction problem. Concurrency and Computation, v. 24, n. 6, p. 635-646, 2012.

  4. Parpinelli, R.S.,Lopes, H.S., Biological plausibility in optimisation: an ecosystemic view. International Journal of Bio-Inspired Computation, v. 4, p. 345-358, 2012. ISSN online: 1758-0374

Edited Books:

  1. Parpinelli, R. S., Lopes, H.S. (Eds.), Theory and New Applications of Swarm Intelligence.  Rijeka, Croatia: Intech, 2012. 194p . ISBN 978-9-535-10364-6 

Book Chapters:

  1. Perlin, H.A., Lopes, H.S., A genetic programming approach for image segmentation. In: A. Chatterjee; P. Siarry. (Eds.), Computational Intelligence in Image Processing. 1ed.Heidelberg: Springer-Verlag, 2012, p. 69-87. ISBN 978-3-642-30621-1

Lecture Notes in Computer Science:

  1. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., A Hierarchical Clustering Strategy to Improve the Biological Plausibility of an Ecology-Based Evolutionary Algorithm. In: Pavón, J.; Duque-Méndez, N.D.; Fuentes-Fernández, R. (Eds.), Lecture Notes in Artificial Intelligence. Heidelberg: Springer, 2012, v. 7637, p. 310-319.

  2. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., An Ecology-Based Heterogeneous Approach for Cooperative Search. In: Barros, L.N.; Finger, M.; Pozo, A.T.; Giménez-Lugo, G.A.; Castilho, M. (Eds.), Lecture Notes in Computer Science. Heidelberg: Springer, 2012, v. 7589, p. 212-221.

  3. Benítez, C.M.V., Lopes, H.S., Molecular Dynamics for Simulating the Protein Folding Process Using the 3D AB Off-Lattice Model. In: Souto, M.C.; Kann, M.G. (Eds.). Lecture Notes in Bioinformatics. 1ed.Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2012, v. 7409, p. 61-72.

  4. Chidambaram, C., Marçal, M.S., Dorini, L.B., Vieira Neto, H, Lopes, H.S., An Improved ABC Algorithm Approach Using SURF for Face Identification. In:  Yin, H.; Costa, J.A.F.; Barreto, G. (Eds.), Proc.13th International Conference on Intelligent Data Engineering and Automated Learning, Lecture Notes in Computer Science. Heidelberg: Springer, v. 7435, p. 143-150, 2012.  

  5. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Population resizing using nonlinear dynamics in an ecology-based approach. In:  Yin, H.; Costa, J.A.F.; Barreto, G. (Eds.), Proc.13th International Conference on Intelligent Data Engineering and Automated Learning, Lecture Notes in Computer Science. Heidelberg: Springer, v. 7435, p. 27-34, 2012. 

Conferences:

  1. Galvão, L.C., Nunes, L.F., Lopes, H.S., Moscato, P., A new greedy heuristic for 3DHP protein struture prediction with side chain. In: IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Workshops (BIBMW), 2012, Philadelphia, p. 77-10, 2012.  

  2. Chidambaram, C., Marçal, M.S., Dorini, L.E.B., Vieira Neto, H., Lopes, H.S., A comparison of histogram and template matching for face verification. In: VIII Workshop de Visão Computacional, 2012, Goiânia, GO, p. 1-6, 2012.

  3. Banaszewski, R.F.; Lopes, H.S.; Tacla, C.A.; Simão, J.M., A comparative study of evolutionary computation techniques for the generalized assignment problem.  In: Brazilian Conference on Intelligent Systems - Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2012, Curitiba, PR., p. 1-8, 2012. 

  4. Cordeiro, J., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Análise de sensibilidade dos parâmetros do bat algorithm e comparação de desempenho. In: Brazilian Conference on Intelligent Systems - Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2012, Curitiba, PR., p. 1-9, 2012.

  5. Krause, J., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Proposta de um algoritmo inspirado em evolução diferencial aplicado ao problema multidimensional da mochila. In: Brazilian Conference on Intelligent Systems - Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2012, Curitiba, PR., p. 1-11, 2012. 

  6. Castilho-Weinert, L.V., Lopes, H.S., Weinert, W.R., Sistema especialista baseado em ontologias aplicado à fisioterapia neuropediátrica. In: Brazilian Conference on Intelligent Systems - Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2012, Curitiba, PR., p. 1-12, 2012.

  7. Weinert, W.R., Lopes, H.S., Um modelo computacional paralelo baseado em programaçao de expressão genética aplicado ao problema de indução de regras de autômatos celulares. In: Brazilian Conference on Intelligent Systems - Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2012, Curitiba, PR., p. 1-12, 2012.

  8. Santos, R.O., Lopes, H.S. . Regressão simbólica sobre séries temporais de dados meteorológicos utilizando programação genética. In: Brazilian Conference on Intelligent Systems - Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2012, Curitiba, PR., p. 1-8, 2012. 

  9. Perlin, H.A., Lopes, H.S., Metodologia híbrida para detecção de pessoas em vídeos. In: VIII Workshop de Visão Computacional, 2012, Goiânia, GO, p. 1-6, 2012.

  10. Prosdossimo, F.C., Chidambaram, C., Lopes, H.S., Proposta de uma metodologia para a construção de um banco de imagens faciais normalizadas. In: VIII Workshop de Visão Computacional, 2012, Goiânia, GO, p. 1-6, 2012.

  11. Oliveira, D.R., Lopes, H.S., Codificação por pólos e zeros para o projeto de filtros digitais de resposta infinita ao impulso utilizando otimização por enxame de partículas. In: Anais do XIX Congresso Brasileiro de Automática, 2012, Campina Grande, PB., 2012.

 

2011:

Journal papers:

  1. Ferlin, E.P., Lopes, H.S., Lima, C.RE., Perretto, M., PRADA: a high-performance reconfigurable parallel architecture based on the dataflow model. International Journal of High-Perfomance Systems Architecture, v. 3, p. 41-55, 2011.

  2. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., New inspirations in swarm intelligence: a survey. International Journal of Bio-Inspired Computation, v. 3, p. 1-16, 2011. ISSN online: 1758-0374

  3. Ferlin, E.P., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Perretto, M., A FPGA-based reconfigurable parallel architecture for high-performance numerical computation. Journal of Circuits, Systems, and Computers, v. 20, p. 849-865, 2011. ISSN online: 1793-6454 

  4. Weinert, W.R., Lopes, H.S., Data mining with a parallel rule induction system based on gene expression programming. International Journal of Innovative Computing and Applications, v. 3, n. 3, p. 136-143, 2011. ISSN online: 1751-6498

  5. Tsunoda, D.F., Freitas, A.A., Lopes, H.S., A genetic programming method for protein motif discovery and protein classification. Soft Computing, v. 15, p. 1897-1908, 2011. ISSN online: 1433-7479

  6. Amaral, C.E.F. ; Lopes, H.S., Arruda, L.V., Hara, M.S. ; Gonçalves, A.J. , Dias, A.A., Design of a complex bioimpedance spectrometer using DFT and undersampling for neural networks diagnostics. Medical Engineering & Physics, v. 33, n. 3, p. 356-361, 2011. ISSN: 1350-4533

  7. Wille, E.C.G., Yabcznski, E., Lopes, H.S., Discrete capacity assignment in IP networks using particle swarm optimization. Applied Mathematics and Computation, v. 17, p. 5338-5346, 2011. ISSN: 0096-3003

Edited Books:

  1. Lopes, H.S., Cruz, L.M. (Eds.), Computational Biology and Applied Bioinformatics.  Rijeka, Croatia: Intech, 2011.

  2. Lopes, H.S., Takahashi, R.H.C. (Eds.), Computação Evolucionária em Problemas de Engenharia. Curitiba: Omnipax Editora, 2011. 385p .

Book Chapters:

  1. Parpinelli, R.S., Benítez, C.M.V., Lopes, H.S.,  Parallel approaches for the artificial bee colony algorithm. In: Yuhui Shi; Meng-Hiot Lim; Bijaya Ketan Panigrahi. (Eds.). Handbook of Swarm Intelligence: principles and applications. Heidelberg: Springer-Verlag, 2011, v. 8, p. 329-345.

  2. Oliveira, D.R., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Bioluminescent Swarm Optimization Algorithm. In: Eisuke Kita. (Eds.). Evolutionary Algorithms. Rijeka, Croatia: Intech, 2011,  p. 69-84.   ISBN 978-953-307-171-8

  3. Chidambaram, C., Benítez, C.M.V., Hembecker, F., Lopes, H.S., A comparative study of machine learning and evolutionary computation approaches for protein secondary structure classification. In: H.S. Lopes; L.M. Cruz. (Eds.). Computational Biology and Applied Bioinformatics. Rijeka: Intech, 2011, p. 239-258.

  4. Olveira, D.R., Salabrin, M.H., Teodoro, F.R., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Comparação de técnicas de computação evolucionária para o projeto de filtros digitais de resposta finite ao impulso. In: H.S. Lopes, R.H.C. Takahashi. (Eds.). Computação Evolucionária em Problemas de Engenharia. Curitiba: Omnipax Editora, 2011, p. 107-128.

Lecture Notes in Computer Science:

  1. Benítez, C.V., Scalabrin, M.H., Lopes, H. S., Erig Lima, C.R., Reconfigurable hardware computing for accelerating protein folding simulations using the harmony search algorithm and the 3D-HP-side chain model. Lecture Notes in Computer Science, v. 7017, p. 363-374, 2011.

Conferences:

  1. Parpinelli, R.S.; Lopes, H.S., An eco-inspired evolutionary algorithm applied to numerical optimization. In: 2011 Third World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing (NaBIC), 2011, Salamanca. 2011 Third World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing. p. 466-471.

  2. Benítez, C.M.V.; Scalabrin, M.H.; Lopes, H.S.; Lima, C.R.E., Reconfigurable Hardware Computing for Accelerating Protein folding simulations using the Harmony Search algorithm and the 3DHP-Side Chain model. In: 1st IEEE International Workshop on Parallel Architectures for Bioinformatics Systems, 2011, Melbourne, Austrália. Proceedings of the IEEE HARDBIO. Piscataway, EUA: IEEE Press, 2011.

  3. Isfer, L.A.; Arruda, L.V.R.; Lopes, H. S. . Identificação De Parâmetros por Enxame de Partículas através do compromisso entre Variância e Polarização. In: Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente, 2011, São João del Rei. Anais do X SBAI, 2011.

  4. Parpinelli, R.S.; Lopes, H.S., Um algoritmo evolutivo eco-inspirado aplicado a otimização numérica. In: Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional, 2011, Fortaleza, CE. Anais do X CBIC, 2011. p. 1-8.

  5. Ambrósio, F.V.; Lopes, H.S.; Erig Lima, C.R., A genetic algorithm for parameter adjustment of an artificial reverberation model. In: Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional, 2011, Fortaleza, CE. Anais do X CBIC, 2011. p. 1-8. 

  6. Oliveira, A.A.; Erig Lima; Lopes, H.S., Projeto de controladores PID em sistemas multivariáveis usando computação evolucionária. In: Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional, 2011, Fortaleza, CE. Anais do X CBIC, 2011. p. 1-8.

  7. Prosdossimo, F.C.; Chidambaram, C.; Lopes, H.S., Otimização da detecção de olhos em imagens faciais utilizando os algoritmos colônia de abelhas artificiais e harmony search. In: Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional, 2011, Fortaleza, CE. Anais do X CBIC, 2011. p. 1-8.

  8. Guerra, E.S.; Lopes, H.S.; Godoy Jr., W., Determinação da função de transferência de um motor ciclo Otto utilizando programação genética. In: X Congresso Brasileiro de Inteligência Computacional, 2011, Fortaleza, CE. Anais do X CBIC, 2011. p. 1-7.

 

2010:

Journal papers:

  1. Lopes, H.S., Erig Lima, C.R., Moritz, G.L., A parallel algorithm for large-scale multiple sequence alignment. Computing and Informatics, v. 29, n. ?, p. 1233-1250, 2010.  ISSN: 1335-9150

  2. Silva, R.R., Erig Lima, C.R.E., Lopes, H.S., Template matching in digital images using a compact genetic algorithm with elitism and mutation. Journal of Circuits, Systems and Computers, v. 19, n. 1, p. 91-106, 2010. 

  3. Kalegari, D.H., Lopes, H.S. A differential evolution approach for protein structure optimization in a 2-D off-lattice protein model, International Journal of Bio-inspired Computation, v. 2, n. 3/4, p. 242-250, 2010. ISSN: 1758-0366

  4. Weinert, W.R., Lopes, H.S. Evaluation of dynamic behavior forecasting parameters in the process of transition rule induction of unidimensional cellular automata. Biosystems, v. 99, n, 1, p. 6-16, 2010. ISSN: 0303-2647

  5. Benítez, C.M., Lopes, H.S. Protein structure prediction with the 3D-HP side-chain model using a master-slave parallel genetic algorithm. Journal of the Brazilian Computer Society, v. 16, n. 1, p. 69-78, 2010.  ISSN: 1678-4804

  6. Chidambaram, C., Lopes, H.S., An improved artificial bee colony algorithm for the object recognition problem in complex digital images using template matching. International Journal of Natural Computing Research, v. 1, n. ?, p. 54-70, 2010 ISSN:1947-9298

  7. Castilho-Weinert, L.V., Lopes, H.S. Sistema de apoio ao diagnóstico em fisioterapia neuropediátrica. Fisioterapia Ser, v. 1, n. 5, p. 35-42, 2010

Book Chapters:

  1. Castilho, L.V., Lopes, H.S. An Ontology-based System for Knowledge Management and Learning in Neuropediatric Physiotherapy. In: Szczerbicki, E., Nguyen, N.T. (Eds.), Smart Information and Knowledge Management, Studies in Computational Intelligence Series, vol. 260, Springer-Verlag, p. ?-?, 2010. ISBN: 978-3-642-04583-7

  2. Benítez, C.M.V, Lopes, H.S., Parallel artificial bee colony algorithm approaches for protein structure prediction using the 3DHP-SC model. IDC

Conferences:

  1. Hembecker, F., Lopes, H.S., A molecular model for representing protein structures and its application to protein folding. Proceedings of 4th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, Chengdu, China, 18-20/june, p. 1-6, 2010.  

  2. Benítez, C.M.V, Lopes, H.S., Protein folding with 3DHP Side-chain model using a hierarchical parallel genetic algorithm. Proc. of IEEE Systems, Man and Cybernetics Conference, Istambul, Turkey, p. 2669 - 2676, 2010.

  3. Talau, M., Wille, E.C.G., Lopes, H.S. An approach for solving the base station placement problem using particle swarm intelligence. International Telecommunications Symposium, Manaus, 2010.

  4. Teodoro, F.R.; Parpinelli, R.S., Lopes, H. S., Otimização por colônia de bactérias aplicada a problemas de engenharia. In: XXXI Iberian-Latin-American Computational Methods in Engineering, 2010, Buenos Aires. CILAMCE´2010. Buenos Aires, 2010.

  5. Scalabrin, M.H.; Parpinelli, R.S., Lopes, H. S., Paralelização do algoritmo harmony search utilizando GPU. In: XXXI Iberian-Latin-American Computational Methods in Engineering, 2010, Buenos Aires. Proceedings of CILAMCE´2010. Buenos Aires, 2010.


2009:

Journal papers:

  1. Castilho-Weinert, L.V., Lopes, H.S., Computers in physical therapy education: interactive multimedia learning with MuStreT. Informatics in Education, v. 8, n. 2, p. 157-172, 2009. ISSN: 1648-5831

 

Lecture Notes in Computer Science:

  1. Tsunoda, D.F., Lopes, H.S., Freitas, A.A. A hybrid evolutionary approach for the protein classification problem.  In: N.T Nguyen, R. Kowalczyk, S-M. Chen (Eds.) Computational Collective Intelligence, Proc. ICCCI/ NICI´2009, Lecture Notes in Artificial Intelligence, v. 5796, p 629-640, 2009.

Book Chapters:

 

Conferences:

  1.  Benitez, C.M., Lopes, H.S., A parallel genetic algorithm for protein folding prediction using the 3DHP side-chain model. Proceedings of IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), Trondheim, Norway, 18-21/may, p. 1297-1304, 2009, ISBN: 978-1-4244-2959-2

  2. Selow, R. Lopes, H.S., Lima, C.R.E. A comparison of FPGA and FPAA technologies for a signal processing application. Proc. 19th International Conference on Field Programmable Logic and Applications (FPL), Praha, Czech Republic, 31/ago-02/set, p. ?-?, 2009

  3. Tsunoda, D.F., Freitas, A.A., Lopes, H.S., MAHATMA: A Genetic Programming-Based Tool for Protein Classification. Proc. International Conference on Intelligent Systems Design and Applications Conference (ISDA), Pisa, Italy, 30/nov-02/dez, p. ??-??, 2009

  4. Chidambaram, C., Lopes, H.S., A new approach for template matching in digital images using an artificial bee colony algorithm. In: Proc. World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing, Coimbatore (NABIC), India, 09-11/12, p. ??-??, 2009.

  5. Tavares, L.G., Lopes, H.S., Erig Lima, C.R., Construction and improvement heuristics applied to the capacitated vehicle routing problem. In: Proc. World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing, Coimbatore (NABIC), India, 09-11/12, p. ??-??, 2009.

  6. Tavares, L.G., Lopes, H.S., Erig Lima, C.R., A study of topology in insular parallel genetic algorithms. In: Proc. World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing, Coimbatore (NABIC), India, 09-11/12, p. ??-??, 2009.

  7. Tavares, L.G., Lopes, H.S., Erig Lima, C.R., Evaluation of weight matrix models in the splice junction recognition problem. In: Proc. IEEE International Conference on Bioinformatics & Biomedicine (BIBM), Washington, USA, 01-04/11, p. ??-??, 2009.

  8.   Benítez, C.V., Lopes, H.S., Algoritmo genético aplicado à predição da estrutura de proteínas utilizando o modelo 3D-HP Side Chain. Anais do VII Encontro Nacional de Inteligência Artificial (ENIA), Bento Gonçalves, RS, p. 717-726, 2009


2008:

Journal papers:

  1. Falcone, M.A., Lopes, H.S., Coelho, L.S. Supply chain optimization using evolutionary algorithms. International Journal of Computer Applications in Technology, v. 31, n. 3/4, p. 158-167, 2008.  ISSN: 1741-5047

 

Lecture Notes in Computer Science:

  1. Perlin, H.A. ; Lopes, H. S. ; Mezzadri, T.C. Particle swarm optimization for object recognition in computer vision. Lecture Notes in Computer Science, v. 5027, p. 11-21, 2008

  2. Tavares, L.G., Lopes, H.S., Erig Lima, C.R. A Comparative study of machine learning methods for detecting promoters in bacterial DNA sequences. Lecture Notes in Artificial Intelligence, v. 5227, p. 959-966, 2008.

  3. Silva, R.R., Lopes, H.S., Erig Lima, C.R., A compact genetic algorithm with elitism and mutation applied to image recognition. Lecture Notes in Artificial Intelligence, v. 5227, p. 1109-1116, 2008.

Book Chapters:

  1. Rodrigues, E.M.L., Lopes, H.S. Evolutionary Grammatical Inference. In:. Rabuñal, J.R., Dorado, J., Pazos, A. (Eds.) Encyclopedia of Artificial Intelligence. Herschey, USA: Information Science Reference, p. 596-602, 2008. ISBN: 978-1-59904-849-9.

  2. Freitas, A.A., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Ant Colony Algorithms for Data Classification. In: Khosrow-Pour, M (Ed.), Encyclopedia of Information Science and Technology, 2nd Edition.  Hershey: IGI Publishing ,  p. 420-424, 2005. ISBN: 978-1-60566-026-4.

  3. Lopes, H.S. Evolutionary algorithms for the protein folding problem: a review and current trends. In: Smolinski, T.G., Milanova, M.M., Hassanien, A-E. (Eds.), Applications of Computational Intelligence in Bioinformatics and Biomedicine: Current Trends and Open Problems. Heidelberg: Springer-Verlag,v. I,  p. 297-315, 2008.

  4. Selow, R., Neves Junior, F., Lopes, H.S. Genetic algorithms and heuristic rules for solving the nesting problem in the package industry. In: Oscar Castillo, Li Xu, Sio-Long. Ao (Eds.), Trends in Intelligent Systems and Computer Engineering. Heidelberg: Springer-Verlag, p. 189-208, 2008. ISBN: 978-0-387-74934-1

Conferences:

  1. Castilho, L.V., Lopes, H.S., Tacla, C.A. Modelling and contruction of an ontology for Neuropediatric Physiotherapy domain. In: Proceedings of 8th International Conference on Hybrid Intelligent Systems, Barcelona (Spain), 10-12/september, IEEE Press, p. 210-215, 2008.

  2. Castilho, L.V., Lopes, H.S., Weinert, W.R. TFM: um sistema multimídia de apoio ao aprendizado de testes de força muscular em Fisioterapia. In: Anais do XXVIII Congresso da SBC - Workshop em Informática Médica, Belém (PA), 12-18/julho, p. 101-110, 2008.

  3. Yabcznski, E., Wille, E.C.G., Lopes, H.S. Algoritmos para solução do problema de atribuição de capacidades discretas em redes TCP/IP. In: Anais do XXVI Simpósio Brasileiro de Telecomunicações, Rio de Janeiro (RJ), 05-05/setembro, p. ??-??, 2008.

  4. Fabro, J., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R. Autonomous robot navigation on a fuzzy mapped environment through neural networks, with evolutionary path planning. Proceedings of RoboControl Workshop, Bauru, SP, [s.p.], 2008.

  5. Lima, C.R.E., Lopes, H.S., Silva, R.R. Embedded FPGA architecture for an educational mobile robot platform. Proceedings of RoboControl Workshop, Bauru, SP, [s.p.], 2008.
     


2007:

Journal papers:

  1. Perretto, M., Lopes, H.S. An ant colony system for large-scale phylogenetic tree reconstruction. Journal of Intelligent and Fuzzy Systems, v. 18, n. 6, p.575-583, 2007. ISBN: 1064-1246

  2. Kugler, M., Lopes, H.S. A Configware Approach for the Implementation of a LVQ Neural Network International Journal of Computational Intelligence Research, v. 3, n. 1, p. 21-25, 2006  ISSN: 1568-4946

  3. Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Murata, N.J. A configware approach for high-speed parallel analysis of genomic data. Journal of Circuits, Systems, and Computers, v. 16, n. 4, p. 1-15, 2007.

  4. Lopes, H.S. Genetic programming for epileptic pattern recognition in electroencephalographic signals. Applied Soft Computing, v. 7,  p. 343-352, 2007  ISSN: 1568-4946

  5. Lopes, H. S. ; Bitello, R. . A differential evolution approach for protein folding using a lattice model. Journal of Computer Science and Technology (Beijing), v. 22, n. 6, p. 904-908, 2007. ISSN: 1000-9000

  6. Bobel, E., Lopes, H.S. Inteligência computacional aplicada à logística de equipes de manutenção de redes de distribuição de energia elétrica. Espaço Energia, v. 7, p. 22-33, 2007. ISSN: 1807-8575.

Lecture Notes in Computer Science:

  1. Hembecker, F., Lopes, H.S., Godoy Jr., W., Particle Swarm Optimization for the Multidimensional Knapsack Problem. Lecture Notes in Computer Science, v. 4331, p. 358-365, 2007.

  2. Silva, R.S., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., A New Mutation Operator for the Elitism-based Compact Genetic Algorithm. Lecture Notes in Computer Science, v. 4331, p. 159-166, 2007.

  3. Lima, C.R.E., Lopes, H.S., Moroz, M.R., Meneses, R.M., Multiple sequence alignment using reconfigurable computing. Lecture Notes in Computer Science, v. 4419, p. 379-384, 2007.

  4. Armstrong Jr., N.B., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Reconfigurable computing for accelerating protein folding simulations. Lecture Notes in Computer Science, v. 4419, p. 314-325, 2007.

  5. Weinert, W.R., Benitez, C., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Simulation of the dynamic behavior of one-dimensional cellular automata using reconfigurable computing Lecture Notes in Computer Science v. 4419, p. 385-390, 2007.

  6. Ferlin, E.P. ; Lopes, H. S. ; Lima, C.R.E. ; Chichaczewski, E. . Reconfigurable parallel architecture for genetic algorithms: application to the synthesis of digital circuits. Lecture Notes in Computer Science, v. 4419, p. 326-336, 2007. 

Book Chapters:

  1. Scapin, M.P., Lopes, H.S. A hybrid genetic algorithm for the protein folding problem using the 2D-HP lattice model. In: Ang Yang, Yin Shan, Lam Thu Bui. (Eds.). Success in Evolutionary Computation. Heidelberg: Springer-Verlag, 2007, v. , p. 205-224. ISBN:

  2. Freitas, A.A., Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Ant Colony Algorithms for Data Classification. In: Khosrow-Pour, M (Ed.), Encyclopedia of Information Science and Technology, 2nd Edition.  Hershey: IGI Publishing ,  p. 420-424, 2007. ISBN:

Conferences:

  1. Selow, R., Neves, F., Lopes, H.S., Genetic algorithms for the nesting problem in the packing industry. In: Proceedings of International Multiconference of Engineers and Computer Scientists. Hong Kong, 21-23/03, p. ?-?, 2007.

  2. Barros, A.M., Lopes, H.S., Stelle, A.L.,Automatic FIR Filter Design Method and Tool based on Genetic Algorithms. In: Proceedings of 1st IEEE Symposium on Computational Intelligence in Image and Signal Processing. Honolulu, USA, 01-05/04, p. 151-156, 2007.

  3. Rodrigues, E.L.M, Lopes, H. S., Genetic Programming for Induction of Context-free Grammars. In: ISDA, 2007, Rio de Janeiro. Proceedings of 7th International Conference on Intelligent Systems Design and Applications. Piscataway, NJ : IEEE Computer Society Press, 2007.

  4. Lima, C.R.E.,Rocha, L.B., Lopes, H.S., Um ambiente para apoio ao aprendizado de automação e controle e sua aplicabilidade no desenvolvimento de competências e habilidades. In: XXXV Congresso Brasileiro de Educação em Engenharia, 2007, Curitiba. Anais do XXXV COBENGE, p. IB9-1-1B9-15 2007.

  5. Weinert, W.R., Lopes H. S., Análise de estratégias para melhoria do desempenho do algoritmo de programação por expressão genética na tarefa de regressão simbólica. In: Anais do I Simpósio Brasileiro de Inteligência Computacional, 2007, Florianópolis, [CD-ROM], 2007

  6. Lopes, H. S., Dalle Molle, V.L., Lima, C.R.E.  Aplicação da otimização por colônia de formigas ao problema de roteamento de múltiplos veículos de capacidade limitada. In: Anais do I Simpósio Brasileiro de Inteligência Computacional, 2007, Florianópolis, [CD-ROM], 2007

  7. Tavares, L., Lima, C.R.E., Lopes, H.S., Estudo comparativo de métodos de aprendizagem de máquina na detecção de regiões promotoras de genes de Escherichia coli. In: Anais do I Simpósio Brasileiro de Inteligência Computacional, 2007, Florianópolis, [CD-ROM], 2007

  8. Rodrigues, E.L.M., Lopes, H.S. Inferência de gramáticas livres de contexto usando programação genética. In: Anais do I Simpósio Brasileiro de Inteligência Computacional, 2007, Florianópolis, [CD-ROM], 2007.

  9. Hembecker, F., Oliveira, D.R., Lopes, H.S. Otimização por enxame de partículas com extinção em massa: uma abordagem aplicada ao problema multidimensional da mochila. In: Anais do I Simpósio Brasileiro de Inteligência Computacional, 2007, Florianópolis, [CD-ROM], 2007


2006:

Journal papers:

  
  1. Tsunoda, D.F., Lopes, H.S. Automatic motif discovery in an enzyme database using a genetic algorithm-based approach. Soft Computing, v. 10, n. 4, p. 325-330, 2006. ISSN: 1432-7643
  2. Felizberto, M.K., Lopes, H.S., Mezzadri, T.C., Arruda, L.V.R. An object detection and recognition system for weld bead extraction from digital radiographs. Computer Vision and Image Understanding, v. 102, p. 238-249, 2006. ISSN: 1077-3142
  3. Osaku, N.O., Lopes, H.S. A dose-response model for the conventional phototherapy of the newborn. Journal of Clinical Monitoring and Computing, v. 20, p. 159-164, 2006.  ISSN:  1387-1307
  4. Osaku, E.F., Lopes, H.S., Aquim, E.E. Avaliação do ensino-aprendizagem em ventilação mecânica nos cursos de Fisioterapia no Paraná. Fisioterapia Brasil, v. 7, n. 2, p. 84-86, 2006. ISSN: 1518-9740.
  5. Souza, A.A.A., Neves Jr., F., Lopes, H.S. Sistema de avaliação da rede secundária de distribuição utilizando algoritmos genéticos. Espaço Energia, v. 5, p. 34-41, 2006. ISSN: 1807-8575
Lecture Notes in Computer Science:
  1. Lopes, H.S., Moritz, G.L. A graph-based genetic algorithm for the multiple sequence alignment problem. Lecture Notes in Artificial Intelligence, v. 4029, p. 420-429, 2006.  ISSN: 0302-9743
  2. Weinert, W.R., Lopes, H.S., GEPCLASS: a classification rule discovery tool using gene expression programming. Lecture Notes in Computer Science, v. 4093, p. 871-880, 2006.  ISSN: 0302-9743
Book chapters:
  1. Lopes, H.S. Introdução à Computação Evolucionária e Aplicações. Capítulo 2, Escola Regional de Informática da Sociedade Brasileira de Computação, Bandeirantes (PR), p. ??-??, 2006.
Conferences:
  1. Coelho, L.S., Lopes, H.S. Supply chain optimization using chaotic differential evolution method. In: Proc. IEEE Int. Conf. on Systems, Man and Cybernectics, 8-11/october, Taipei, Taiwan, v. 4, p. 3114-3119, 2006
  2. Hafner, A.A., Lima, C.R.E., Lopes, H.S. An electric energy quality meter using hardware reconfigurable computing. Proc. 1st IEEE International Conference on Industrial Electronics and Applications, Singapore, Singapore, 24-26/maio/2006, v. 1, p. 1-6, 2006.
  3. Armstrong Jr., N., Lopes, H.S., Lima, C.R.E. Preliminary steps towards protein folding prediction using reconfigurable computing. Proc. IEEE International Conference on Reconfigurable Computing and FPGA's (RECONFIG), San Luis de Potosi, Mexico, 20-22/09, IEEE Computer Press, p. 1-7, 2006
  4. Moritz, G.L., Jory, C., Lima, C.R.E., Lopes, H.S., Lima, C.R.E. Implementation of a parallel algorithm  for protein pairwise alignment using reconfigurable computing. Proc. IEEE International Conference on Reconfigurable Computing and FPGA's (RECONFIG), San Luis de Potosi, Mexico, 20-22/09, IEEE Computer Press, p. 1-7, 2006.
  5. Lopes, H.S., Osaku, N.O. A method for computing the radiant energy density in the conventional phototherapy of the newborn. In: Proc. Brazilian Congress on Biomedical Engineering, São Pedro (SP), 2006.
  6. Barros, A.M., Stelle, A.L., Lopes, H.S. A FIR filter design tool using genetic algorithms. In: Anais do XXXIV Congresso Brasileiro de Ensino de Engenharia - COBENGE, Passo Fundo (RS), p. 1799-1811, 2006.
  7. Barros, A.M., Stelle, A.L., Lopes, H.S., FIR filter design using genetic algorithms with a minimum number of parameter adjustments. In: Proceedings of the XXVII Iberian Latin-American Congress on Computational Methods in Engineering - CILAMCE, Belém (PA), p. ?-?, 2006.
  8. Moritz, G.L., Lopes, H.S., Lima, C.R.E. Hardalign: a parallel pairwise alignment hardware application. Proc.  IEEE International Conference on Field Programmable Technology, Bangkok, Thailand, IEEE Press, p. 369-372, 2006
  9. Schneider, M., Lopes, H.S., Pedroni, V.A. Object detection in a computer vision system using particle swarm optimization. In: Proceedings of the XXVII Iberian Latin-American Congress on Computational Methods in Engineering - CILAMCE, Belém (PA), p. ?-?, 2006. 
  10. Amaral, C.E., Lopes, H.S. A DFT-Based multifrequencial complex bioimpedance analyzer. In: Proc. Brazilian Congress on Biomedical Engineering, São Pedro (SP), 2006.
  11. Rodrigues, E.L., Lopes, H.S. Genetic programming with incremental learning for grammatical inference. In: Proceedings of 6th International Conference on Hybrid Intelligent Systems, Auckland, New Zealand, 13-15/december, p. 47-47, 2006.
  12. Lima, C.R.E., Silva, R.R., Lopes, H.S., Pedroso, J.M. Ambiente para apoio ao aprendizado de automação e controle baseado em lógica reconfigurável. Anais do XVI Congresso Brasileiro de Automática, Salvador (BA), p. 2584-2589, 2006.
  13. Hafner, A.A., Lima, C.R.E., Lopes, H.S.  Estudo e simulação dos módulos lógicos de um medidor de qualidade de energia elétrica. Anais do XVI Congresso Brasileiro de Automática, Salvador (BA), p. 3061-3066, 2006.
  14. Calixto, S.Z., Lopes, H.S. Avaliação da bioimpedância em recém-nascidos com síndrome do desconforto respiratório. In: Anais do Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, São Pedro (SP), 2006.
Other:

2005:

Journal papers:
  1. Calixto, S.Z., Lopes, H.S., Aquim, E.E., Desmame da prótese ventilatória de recém-nascidos: uma questão em aberto. Fisioterapia Brasil, v. 6, n.3, p. 217-222, 2005. ISSN: 1518-9740.
  2. Perretto, M., Lopes, H.S. Reconstruction of phylogenetic trees using the ant colony optimization paradigm. Genetics and Molecular Research, v. 4, n. 3, p. 581-589, 2005. ISSN: 1676-5680
Lecture Notes in Computer Science:
  1. Tsunoda, D.F.,  Lopes, H.S., Freitas, A.A.  An evolutionary approach for motif discovery and transmembrane protein classification. In: Proc. 3rd European Workshop on Evolutionary Bioinformatics, 31/march-01/april, Lausanne (Switzerland). Lecture Notes in Computer Science, v. 3449, p. 105-114, 2005. ISSN: 0302-9743
  2. Maruo, M.H.,  Lopes, H.S., Delgado, M.R.B.S.  Self-adapting evolutionary parameters: encoding aspects for combinatorial optimization problems. In: Proc. 5th European Conference on Evolutionary Computation in Combinatorial Optimization, 31/march-01/april, Lausanne (Switzerland). Lecture Notes in Computer Science, v. 3448, p. 154 - 165, 2005. ISSN: 0302-9743
  3. Centeno, T.M., Lopes, H.S., Felizberto, M.K., Arruda, L.V.R., Object detection for computer vision using a robust genetic algorithm. In: Proc. 7th European Workshop on Evolutionary Computation in Image Analysis and Signal Processing, 31/march-01/april, Lausanne (Switzerland). Lecture Notes in Computer Science, v. 3449, p. 284-293, 2005.  ISSN: 0302-9743
  4. Lopes, H.S., Scapin, M.P., An Enhanced Genetic Algorithm for Protein Structure Prediction Using the 2D Hydrophobic-Polar Model. Proc. of 7th International Conference on Artificial Evolution, Lille, France, 26-28/outubro. Lecture Notes in Computer Science, v. 3871, p. 238-246, 2005.  ISSN: 0302-9743
Book Chapters:
  1. Machado, T.R., Lopes, H.S. A hybrid particle swarm optimization model for the traveling salesman problem. In: Ribeiro, B., Albrecht, R.F., Dobnikar, A. et al (eds.), Adaptive and Natural Computing Algorithms. Wien: SpringerWienNewYork, 255-258, 2005. ISBN: 3211249346.
  2. Tsunoda, D.F.,  Lopes, H.S., Vasconcelos, A.T. Web-based tools for molecular biological data analysis. In: Khosrow-Pour, M (Ed.), Encyclopedia of Information Science and Technology.  Hershey: Idea Group Inc., p. 3068-3073, 2005. ISBN: 1-59140-553-X 
  3. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Classification rule discovery with an ant colony algorithm. In: Khosrow-Pour, M (Ed.), Encyclopedia of Information Science and Technology.  Hershey: Idea Group Inc.,  p. 420-424, 2005. ISBN: 1-59140-553-X 
Conferences:
  1. Lopes, H.S., Coelho, L.S., Particle swarm optimization with fast local search for the blind travelling salesman problem. Proceedings of 5th International Conference on Hybrid Intelligent Systems, Rio de Janeiro, RJ, 06-09/novembro, p. 245-250, 2005.  
  2. Osaku, N.O., Lopes, H.S., Phototherapy of the newborn: a predictive model for the outcome. Proceedings of the 27th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS). Shanghai, China, 01-04/september, p. 6725-6728, 2005. 
  3. Lopes, H.S., Moritz, G.L. A distributed approach for a multiple sequence alignment algorithm using a parallel virtual machine. Proceedings of the 27th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBS). Shanghai, China, 01-04/september, p. 2843-2846, 2005.
  4. Lopes, H.S., Dalle Molle, V.L., Lima, C.R.E. An ant colony optimization system for the capacitated vehicle routing problem. Proceedings of the XXVI Iberian Latin-American Congress on Computational Methods in Engineering - CILAMCE, Guarapari, ES, 19-21/outubro, CD-ROM, 2005
  5. Lopes, H.S., Corrêa, G.C., Galvão, L.C., Nunes, L.F. Optimized electric power substation location using p-medians and Voronoi diagrams. Proceedings of the XXVI Iberian Latin-American Congress on Computational Methods in Engineering - CILAMCE, Guarapari, ES, 19-21/outubro, CD-ROM, 2005
  6. Falcone, M.A., Lopes, H.S., Coelho, L.S. Otimização de um modelo de cadeia de suprimento simplificada usando evolução diferecial. Anais do VII CBRN - Congresso Brasileiro de Redes Neurais, Natal, RN, 16-19/outubro, CD-ROM, 2005.
  7. Santos, A.F., Gebara Junior, M., Lopes, H.S., Cinemática inversa de trajetórias de manipuladores robóticos redundantes utilizando algoritmos genéticos com redução progressiva do espaço de busca. Anais do VII Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, São Luís, MA, 18-23/setembro, p. ?-?, 2005.
  8. Hafner, A., Lima, C.R.E.,  Lopes, H.S., Implementação de um medidor de qualidade de energia usando computação reconfigurável por hardware.  Anais do VII Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, São Luís, MA, 18-23/setembro, CD-ROM, 2005.
Other:
  1. Benítez, C.M.V., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Silva, R.R. Modelagem, simulação e controle de motor DC em lógica reconfigurável por hardware. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 29-32, 2005.
  2. Moritz, G.L., Lopes, H.S., Um algoritmo genético para alinhamento múltiplo de proteínas. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 33-36, 2005.
  3. Pereira, G.M.F., Lopes, H.S., Lima, C.R.E. Implementação de um gerador de núeros aleatórios usando lógica reconfigurável, VHDL e FPGA. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 37-40, 2005
  4. Ruthes, H, Lopes, H.S., Desenvolvimento de um analisador multifreqüencial de impedância elétrica. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 57-60, 2005.
  5. Kenor, J.M., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Lógica reconfigurável por hardware aplicada a problemas combinatoriais. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 173-176, 2005.
  6. Murata, N.J., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Análise de seqüências de DNA utilizando lógica reconfigurável por hardware. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 177-180, 2005.
  7. Rayel, O.K., Lopes, H.S., Lima, C.R.E., Hafner, A.,A. Implementação da transformada rápida de Fourier em lógica reconfigurável a partir da linguagem VHDL.. In: Anais do X Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 08-10/agosto, p. 181-184, 2005.

2004:

  1. Journal papers:
    1. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A.  A constrained-syntax genetic programming system for discovering classification rules: application to medical data sets. Artificial Intelligence in Medicine, v. 30, n. 1, p. 27-48, 2004 ISSN: 0933-3657. Link 14684263
    2. Weinert, W., Lopes, H.S. Neural networks for protein classification. Applied Bioinformatics, v. 3, n. 1, p. 41-48, 2004.  ISSN: 1175-5636
    3. Lopes, H.S., Weinert, W.R. EGIPSYS: a enhanced gene expression programming approach for symbolic regression problems. International Journal of Applied Mathematics and Computer Science, v. 14, n. 3, p. 375-384, 2004. ISSN: 1641-876X
    4. Castilho, L.V., Lopes, H.S., Brandalize, S.R.C. Discrepâncias entre os testes de força muscular: uma análise comparativa. Fisioterapia em Movimento, v. 17, n. 2, p. 37-43, 2004.  ISSN: 0103-5150
  2. Lecture Notes in Computer Science:
    1. Alves, R.T., Delgado, M.R.B.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A., An artificial immune system for fuzzy-rule induction in data mining. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer-Verlag, v. 3242, p. 1011-1020, 2004. ISSN: 0302-9743
  3. Conferences:
    1. Britto, J., Lopes, H.S. Mobile computing on telemedicine and distance learning: application on surgery pediatric oncology. Proceedings of 2nd IEEE International Workshop on Wireless and Mobile Technologies in Education (WMTE 2003), JungLi (Taiwan), 23-25/march, p. 139-143, 2004. 
    2. Felizberto, M.K., Mezzadri, T.C., Arruda, L.V.R., Lopes, H.S., Automatic analysis of radiographic images for non destructive test applications. In: Proceedings of 10th SEM International Congress on Experimental and Applied Mechanics, Costa Mesa (CA), USA, [CD-ROM], 2004.
    3. Alves, R.T., Delgado, M.R.B.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A., Induction of fuzzy classification rules with an artificial immune systemProceedings of the 8th Brazilian Symposium on Neural Networks (SBRN), São Luis, MA, Los Alamitos: IEEE Computer Press, [CD-ROM], 2004. 
    4. Lopes, H.S., Weinert, W.R. A gene-expression programming system for time-series modeling. In: Proceedings of XXV Iberian Latin American Congress on Computational Methods in Engineering (CILAMCE), Recife (PE), 10-12/november, [CD-ROM], 2004.
    5. Perretto, M., Lopes, H.S. Reconstruction of phylogenetic trees using the ant colony optimization paradigm. In: Proceedings of 3rd. Brazilian Workshop on Bioinfomatics, Brasília (DF), 20-22/october, [CD-ROM], 2004.
    6. Scapin, M.P., Lopes, H.S. Protein structure prediction using an enhanced genetic algorithm for the 2D HP model. In: Proceedings of 3rd. Brazilian Workshop on Bioinfomatics, Brasília (DF), 20-22/october, [CD-ROM], 2004.
    7. Corrêa, G.C., Lopes, H.S., Galvão, L.C., Nunes, L.F., Otimização da locação de subestações para o planejamento da expansão da rede elétrica de distribuição utilizando o algoritmo de Teitz e Bart e diagramas de Voronoi. In: Anales del X Congreso Latino-Americano de Investigación Operativa, La Habana, Cuba, 04-06/outubro, [CD-ROM], 2004.
    8. Calvo, R., Delgado, M.R.B.S., Lopes, H.S., Figueiredo, M. Indução de regras nebulosas via sistemas classificadores para o controle da arquitetura em redes neurais construtivas para navegação autônoma. Anais do VIII Simpósio Brasileiro de Redes Neurais (SBRN), São Luis,MA, [CD-ROM], 2004. 
  4. Other:
    1. Moritz, G.L., Lopes, H.S., Implementação paralela do Clustal para alinhamento múltiplo de proteínas. In: Anais do IX Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 03-05/agosto, p. 94-97, 2004.
    2. Kaimoto, C.V.M., Lopes, H.S., Análise computacional de DNA. In: Anais do IX Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 03-05/agosto, p. 30-33, 2004.

2003:

  1. Journal papers:
    1. Lopes, H.S., Dias, A.A. Extracting knowledge from the p53 mutation database: the influence of tabagism in the somatic mutations profile of lung cancer subjects. Revista Tecnologia da Informação, v. 3, n. 2, p. 87-89, 2003. ISSN: 1516-9197
    2. Gonzaga, C.D.T., Lopes, H.S., Paulin, C. A Informática no ensino da Fisioterapia: uma aplicação na avaliação da atividade reflexa do recém-nascido. Jornal Paranaense de Pediatria, v. 4, n. 2, p. 104, junho 2003. ISSN: 1676-0166.
    3. Budant, T.C.M., Lopes, H.S. Análise da variabilidade dos parâmetros acústicos da voz na adolescência. Jornal Brasileiro de Fonoaudiologia, v. 4, n. 17, p. 238-243, out/dez 2003. ISSN: 1517-5308.
  2. Lecture Notes in Computer Science:
    1. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A. An innovative application of a constrained-syntax genetic programming system to the problem of  predicting survival of patients. Proceedings of the European Conference on Genetic Programming, Essex, UK, 2003., Lecture Notes in Computer Science, v. 2610,  p. 11-21, 2003 ISSN: 0302-9743.
  3. Conferences:
    1. Tsunoda, D.F., Lopes, H.S. Feature discovery in a protein database using a memetic algorithm-based solution. Proceedings of International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Ribeirão Preto (Brazil), 14-16/may/2003. 
    2. Weinert, W.R., Lopes, H.S. A neural networks system for enzymes classification. Proceedings of International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Ribeirão Preto (Brazil), 14-16/may/2003, [CD-ROM].
    3. Lopes, H.S., Dias, A.A. Extracting knowledge from the p53 mutation database: the influence of tabagism in the somatic mutations profile of lung cancer subjects. Proceedings of the Second Brazilian Workshop on Bioinformatics, Macaé (RJ), 05-08/dez/2003, [CD-ROM].
    4. Amaral, C.E.F., Hara, M.S., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R., Gonçalves, A.J., Dias, A.A. Diagnóstico de câncer de cabeça e pescoço baseado em redes neurais e dados de bioimpedância. Anais do VI Congresso Brasileiro de Redes Neurais, São Paulo (SP), 02-05/junho/2003, p. 139-142, 2003.
    5. Kugler, M., Tortato Júnior, J., Lopes, H.S. Desenvolvimento de uma rede neural LVQ em linguagem VHDL para aplicações em tempo-real. Anais do VI Congresso Brasileiro de Redes Neurais, São Paulo (SP), 02-05/junho/2003, p. 103-108, 2003.
    6. Weinert, W.R., Lopes, H.S. Aplicação de um sistema neural ao problema de classificação de proteínas. Anais do VI Congresso Brasileiro de Redes Neurais, São Paulo (SP), 02-05/junho/2003, p. 85-90, 2003.
    7. Tsunoda, D.F., Lopes, H.S. ENZCLASS - classificador baseado em algoritmo memético e árvore de decisão para a descoberta e seleção de seqüências de aminoácidos em enzimas. Anais do III Congresso Brasileiro de Computação, Itajaí (SC), 25-29/agosto, p. 2149-2160, 2003.
  4. Other:
    1. Montanher, M.C., Lopes, H.S., Moritz, G.L. Alinhamento de seqüências de proteínas utilizando processamento paralelo..Anais do VIII Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 13-15/agosto, p. 84-87, 2003.

2002:

  1. Journal papers:
    1. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Data mining with an ant colony optimization algorithm. IEEE Transactions on Evolutionary Computation, v. 6, n. 4, p. 321-332, august, 2002. ISSN: 1089-778X.
    2. Kalinke, L.K., Lopes, H.S., Michalkiewicz, E.L. Sistema informatizado para apoio à coordenação e monitoração de estudos clínicos. Interface, v. 1, n. 4, p. 11-14, dez. 2002. ISSN: 1519-8855.
  2. Lecture Notes in Computer Science:
    1. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Mining comprehensible rules from data using an ant colony algorithm. In: Bittencourt, G., Ramalho, G.L. (Eds.) Advances in Artificial Intelligence, Lecture Notes in Artificial Intelligence, Berlin: Springer-Verlag, v. 2507, p. 259-269, 2002. ISSN: 0302-9743.
  3. Book chapters:
    1. Valente, S.A., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R. Genetic algorithms for the assembly line balancing problem: a real-world automotive application. In:  Roy, R., Köppen, M., Ovaska, S., Fukuhashi, T., Hoffman, F. Soft Computing in Industry - Recent Applications. Berlin: Springer-Verlag, p. 319-328, 2002. ISBN 1-85233-539-4.
  4. Conferences:
    1. Kugler, M., Lopes, H.S. Using a chain of LVQ neural networks for pattern recognition of EEG signals related to intermitent photic stimulation Proceedings of Brazilian Symposium on Neural Networks, Recife (PE), 11-14/november, IEEE Computer Society, p. 173-177, 2002. ISBN: 0-7695-1709-9
    2. Tsunoda, D.F., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Um algoritmo evolucionário para a identificação de seqüências de aminoácidos na estrutura primária de proteínasAnais do XVIII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, São José dos Campos (SP), 09-12/setembro, v. 2, p. 208-213, 2002. 
    3. Puchalski, L.K., Lopes, H.S. O desenvolvimento de um sistema informatizado para coordenação e monitoração de pesquisas clínicas em oncologiaAnais de Resumos do  XVIII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, São José dos Campos (SP), 09-12/setembro, p. 196, 2002.
    4. Kugler, M., Mukai, I.N., Lopes, H.S., Pilla Júnior, V.  Reconhecimento de padrões de EEG relacionados a potenciais evocados por foto-estimulação intermitenteAnais do XVIII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, São José dos Campos (SP), 09-12/setembro, v. 5, p. 423-426, 2002. 
    5. Budant, T.C.M., Lopes, H.S. Estudo da variação dos parâmetros acústicos da voz para o estabelecimento de padrão de normalidade em adolescentes. Anais de Resumos do XVIII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, São José dos Campos (SP), 09-12/setembro, p. 384, 2002.
    6. Britto, J., Lopes, H.S., Michalkiewicz, E. Computação móvel em telemedicina: aplicação ao ensino de cirurgia oncológica.  Anais do VIII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, Natal (RN), 29/setembro-02/outubro, [CD-ROM], 2002. 
  5. Other:
    1. Carta Neto, A., Lopes, H.S., Pilla Júnior, V. Reconhecimento de padrões no EEG com programação genética, Anais do VII Seminário de Iniciação Científica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 24-26/julho, p. 1-4, 2002.

2001:

  1. Book chapters:
    1. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A. An ant colony algorithm for classification rule discovery. In: Abbas, H.A., Sarker, R.A., Newton, C.S. (eds.) Data Mining: A Heuristic Approach., Hershey: Idea Group Publishing, v.1, p. 190-208, 2001. ISBN 1-9307-0825-4.
  2. Conferences:
    1. Janeczko, C., Lopes, H.S. Modeling and simulation of the human electroencephalographic activity. Proceedings of 10th International Symposium on Systems - Modelling - Control, Zakopane, Poland,  2001.
    2. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Constrained-syntax genetic programming for knowledge discovery in medical databases. Proceedings of 10th International Symposium on Systems - Modelling - Control, Zakopane, Poland,  2001.
    3. Malinowski, F.C., Lopes, H.S., Neves Junior, F.S. Scheduling optimization in a car assembly line using genetic algorithms. Proceedings of 10th International Symposium on Systems - Modelling - Control, Zakopane, Poland,  2001.
    4. Parpinelli, R.S., Lopes, H.S., Freitas, A.A. An ant colony based system for data mining: applications to  medical data. Proceedings of GECCO2001 - Genetic and Evolutionary Computation Conference, San Francisco, USA, p. 791-797, 2001.
    5. Kugler, M., Mukai, I.N., Lopes, H.S., Pilla Júnior, V. Recognition of EEG patterns related to evoked potentials by intermittent photo-stimulation. In: V. Faramarz (Ed.), Proceedings of METMBS2001 - International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences, Las Vegas, USA, p. 344-350, 2001.
    6. Valente, S.A., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R. Genetic algorithms for the assembly line balancing problem: a real-world automotive application. Proceedings of the 6th On-line World Conference on Soft Computing in Industrial Applications, september 10-24/2001.
    7. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Data mining with constrained-syntax genetic programming: applications in medical data sets. Proceedings of IDAMAP'2001 - Intellingent Data Analisys in Medicine and Pharmacology - MEDINFO, London, 4/sept/2001.
    8. Mukai, I.N., Pilla Junior, V., Lopes, H.S. Análise de preditores no domínio do tempo para classificadores LVQ na detecção de padrões de EEG relacionados ao movimento. Anais do IV Congresso Brasileiro de Redes Neurais - CBRN, Rio de Janeiro, 02-05/abril, p. 253-258, 2001.
    9. Fabro, J.A., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R. Navegação de robôs autônomos utilizando redes neurais, com planejamento de trajeto por algoritmos genéticos baseados em um mapa fuzzy. Anais do IV Congresso Brasileiro de Redes Neurais - CBRN, Rio de Janeiro, 02-05/abril, p. 247-252,  2001.
    10. Britto, J., Lopes, H.S. Mineração de regras fuzzy em bancos de dados por algoritmos genéticos. Anais do IV Congresso Brasileiro de Redes Neurais - CBRN, Rio de Janeiro, 02-05/abril, p. 241-246, 2001.
    11. Evangelista, M.A., Neves Jr., F., Lopes, H.S. Desenvolvimento de modelos de inferência utilizando programação genética. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001.
    12. Correa, G.C.,  Lopes, H.S. Otimização do atendimento de cargas de subestações utilizando algoritmos genéticos. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001.
    13. Valente S.A., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R. Algoritmos genéticos no problema de balanceamento de linhas de montagem: uma aplicação real numa linha automotiva. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001.
    14. Bobel, E., Lopes, H.S. Otimização da logística de manutenção corretiva em redes de distribuição de energia elétrica por algoritmos genéticos. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001. 
    15. Malinowski, F., Lopes, H.S., Neves Jr., F. Otimização do sequenciamento de veículos numa linha de montagem de veículos utilizando algoritmos genéticos. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001.
    16. Selow, R., Lopes, H.S., Neves Jr., F. Algoritmos genéticos para o problema de aninhamento na indústria de embalagens: um estudo com modelos reduzidos. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001.
    17. Souza, A.A.A., Neves Jr., F., Lopes, H.S. Sistema de Avaliação da Rede Secundária de Distribuição Utilizando Algoritmos Genéticos. Anais do V Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, Canela, RS, 7-9/novembro, [CD-ROM], 2001.
  3. Other:
    1. Carta Neto, A., Lopes, H.S., Pilla Júnior, V. Análise de preditores no domínio do tempo aplicados ao reconhecimento de padrões de EEG relacionados ao movimento. Anais do VI Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 15-17/agosto, p. 63-66, 2001.

2000:

  1. Journal papers:
    1. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Genetic programming for knowledge discovery in chest pain diagnosis. IEEE Engineering in Medicine and Biology Magazine, v. 19, n. 4, p. 38-44, july/august, 2000. ISSN: 0739-5175. Link 10916731 
  2. Conferences:
    1. Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Pattern recognition in electroencephalographic signals using LVQ neural networks. Proceedings of ANNIE2000 - Artificial Neural Networks in Engineering, USA, p. 727-732, 2000.
    2. Noda, E., Freitas, A.A., Lopes, H.S. Comparing genetic algorithms with rule induction algorithms in the data mining task of dependence modeling. Proceedings of GECCO2000 - Genetic and Evolutionary Computation Conference, Las Vegas, USA, p. 1080, 2000.
    3. Araújo, D.L.A., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Rule discovery with a parallel genetic algorithm. Proceedings of GECCO2000 - Genetic and Evolutionary Computation Conference, Workshop Program, Las Vegas, USA, p. 89-92, 2000.
    4. Janeczko, C., Lopes, H.S. Background EEG activity simulation using autoregressive models and double modulation. Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Chicago, USA, [CD-ROM], 2000.
    5. Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Detection of movement-related desynchronization of the EEG using neural networks. Proceedings of the 22nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Chicago, USA, v. 2, p. 1372 -1376, 2000.
    6. Fidelis, M.V., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Discovering comprehensible classification rules using a genetic algorithm. Proceedings of CEC-2000, Conference on Evolutionary Computation La Jolla, USA, v. 1, p. 805-811, 2000.
    7. Janeczko, C., Lopes, H.S. A genetic approach to ARMA filter synthesis for EEG signal simulation. Proceedings of CEC-2000, Conference on Evolutionary Computation La Jolla, USA, v. 1, p. 373-379, 2000.
    8. Mulá, M.A.V., Lopes, H.S. Implementação de um banco de dados para sinais de EEG. Anais do XVII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica Florianópolis (SC), 11-13/setembro, v. 2, p. 1393-1397, 2000.
    9. Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Análise do desempenho de um classificador neural de sinais de EEG na detecção de movimentos. Anais do XVII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica Florianópolis (SC), 11-13/setembro, v. 2, p. 1341-1345, 2000.
  3. Other:
    1. Fabro, J.A., Lopes, H.S., Arruda, L.V.R. Navegação autônoma de veículos utilizando redes neurais, com planejamento de trajetórias por algoritmos genéticos. Anais do EPOGRASS - 1o. Encontro dos Programas de Pós-Graduação Strictu Sensu dos CEFET's, Belo Horizonte (MG), 19-20/outubro, p. 72-75, 2000.
    2. Mukai, I.N., Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Reconhecimento de padrões de EEG relacionados ao movimento. Anais do V Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 5-7/junho, p. 53-56, 2000.
    3. Bertin, M., Sovierzoski, M., Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Desenvolvimento de um sistema de alto desempenho para aquisição e processamento digital de sinais biomédicos. Anais do V Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 5-7/junho, p. 29-32, 2000.
    4. Perini, F.A.B., Jasinski, R.P., Lopes, H.S. Joystick/Teclado acionado por EOG para micros IBM-PC. Anais do V Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 5-7/junho, p. 5-8, 2000.
    5. Mukai, I.N., Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Processamento digital de sinais para uma interface cérebro-computador (BCI-Brain-Computer Interface). Anais do IX Encontro Anual de Iniciação Científica. Londrina (PR), Brasil, 2-7/junho, v. 1, p. 640-641, 2000
    6. Mukai, I.N., Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Reconhecimento de padrões de EEG relacionados ao movimento da mão. (BCI-Brain-Computer Interface). Anais do IX Encontro Anual de Iniciação Científica. Londrina (PR), Brasil, 2-7/junho, v. 1, p. 642-643, 2000
    7. Leskov, I.F., Lopes, H.S., Pilla Júnior, V. Amplificador e filtros de baixo custo para sinais de EEG (Eletroencefalografia). Anais do 8o. Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP. São Paulo (SP),  [CD-ROM], 2000
    8. Mukai, I.N., Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Análise de classificadores neurais para o reconhecimento de padrões de EEG relacionados ao movimento. Anais do 8o. Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP. São Paulo (SP), [CD-ROM], 2000

1999:

  1. Book chapters:
    1. Lopes, H.S. A medical diagnostic system optimization using parallel genetic algorithms. in: Szczepaniak, P.S. (ed.), Computational Intelligence and Applications. Heidelberg: Physica-Verlag, p. 222-227, 1999. ISBN 3-7908-1161-0
  2. Conferences:
    1. Noda, E., Freitas, A.A., Lopes, H.S. Discovering interesting prediction rules with a genetic algorithm. Proceedings of CEC'99 - Congress on Evolutionary Computation (CEC-99). Washington D.C., USA, 6-9/July, v. 2, p. 1322-1329, 1999
    2. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Discovering comprehensible classification rules using genetic programming: a case study in a medical domain. Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO-99). Orlando, FL, USA, 13-17/july, v. 2, p. 953-958, 1999
    3. Araújo, D.L.A., Lopes, H.S., Freitas, A.A. A parallel genetic algorithm for rule discovery in large databases. Proceedings of IEEE Systems, Man and Cybernetics Conference. Tokyo, Japan, 12-15/october, v. III, p. 940-945, 1999.
    4. Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Evolutionary training of a neurofuzzy network for detection of the P wave of the ECG. Proceedings of ICCIMA - 3rd. International Conference on Computational Intelligence and Multimidia Applications. New Delhi, India, 23-26/september. Los Alamitos: IEEE Computer Society, p. 102-106, 1999. ISBN: 0-7695-0300-4.
    5. Gebara Júnior, M., Santos, A.F., Lopes, H.S. Inverse kinematics of trajectories of redundant robotic manipulators using genetic algorithms with range reduction. Proceedings of 15th ISPE/IEE International Conference on CAD/CAM, Robotics, and Factories of the Future, 18-20/august, Águas de Lindóia, Brazil, v. 2, p. RT4.10-4.15, 1999.
    6. Lopes, H.S. Algoritmos genéticos em projetos de engenharia: aplicações e perspectivas futuras. Anais do SBAI'99 - 4o. Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente. São Paulo, 08-10/setembro, p. 64-74, 1999.
    7. Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Reconhecimento de padrões em sinais eletrocardiográficos com rede neurofuzzy e algoritmos genéticos. Anais do IV Congresso Brasileiro de Redes Neurais, 20-22/julho, São José dos Campos (SP), p. 42-46, 1999.
    8. Santos, R.T., Nievola, J.C., Freitas, A.A., Lopes, H.S. Extração de regras de redes neurais via algoritmos genéticos. Anais do IV Congresso Brasileiro de Redes Neurais, 20-22/julho, São José dos Campos (SP) p. 158-163, 1999.
    9. Fidelis, M.V., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Um algoritmo genético para descobrir regras de classificação em data-mining. Anais do XIX Congresso Nacional da Sociedade Brasileira de Computação - IV Encontro Nacional de Inteligência Artificial, 20-21/julho, Rio de Janeiro (RJ), p. 17-30, 1999.
    10. Bojarczuk, C.C., Lopes, H.S., Freitas, A.A. Programação genética e data mining para a descoberta de conhecimento em medicina. Anais do XIX Congresso Nacional da Sociedade Brasileira de Computação - IV Encontro Nacional de Inteligência Artificial, 20-21/julho, Rio de Janeiro (RJ), p. 31-42, 1999.
  3. Other:
    1. Silva, F.M.D., Lopes, H.S. Implementação de um Colorímetro com Led Bicolor. Anais do IV Seminário de Iniciação Científica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 21-23/julho, p. 59-62, 1999.
    2. Mukai, I.N., Pilla Júnior, V., Lopes, H.S. Processamento Digital de Sinais de uma Interface Cérebro-Computador. Anais do IV Seminário de Iniciação Científica, CEFET-PR Curitiba (PR), Brasil, 21-23/julho, p. 75-78, 1999.

1998:

  1. Conferences:
    1. Lopes, H.S.  On using parallel genetic algorithms for large-scale optimization problems: a case report. Proceedings of 9th International Symposium on Systems - Modelling - Control, Zakopane, Poland, [CD-ROM], 1998.
    2. Marchesi, B., Lopes, H.S.  Detecção de padrões epilépticos no EEG através do paradigma da programação genética Anais do IV Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde (FNCTS), Curitiba, PR, 18-22/10/98, p. 503-504.
    3. Zelak, A., Lopes, H.S. Aplicação de instrumentação virtual na análise de sinais biomédicos. Anais do IV Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde (FNCTS), Curitiba, PR, 18-22/10/98, p 249-250.

1997:

  1. Journal papers:
    1. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Heinisch, R., Barreto, J.M., Lima, W.C. A knowledge-based system for decision support in chest pain diagnosis. Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, Nice (France), 14-19/09/97. Medical & Biological Engineering & Computing, v. 35, suppl., part I, p. 514.
  2. Book chapters:
    1. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. An evolutionary approach to simulate cognitive feedback learning in medical domain. In: Sanchez, E., Shibata, T., Zadeh, L.A. (eds.), Genetic Algorithms and Fuzzy Logic Systems. Singapore: World Scientific, p. 193-207, 1997. ISBN 981-02-2423-0
  3. Conferences:
    1. Marchesi, B., Stelle, A.L., Lopes, H.S. Genetic programming in the detection of epileptic events. Proceedings of IEEE-Engineering in Medicine and Biology Society Conference, Chicago (USA), 30/10-02/11/97, v. 3, p. 1198-1201, 1997.
    2. Marchesi, B., Stelle, A.L., Lopes, H.S. Programação genética na detecção de eventos epilépticos: resultados preliminares. In: Caloba, L., Barreto, J.M. (eds.), Anais do III Congresso Brasileiro de Redes Neurais (CBRN), Florianópolis, SC, 20-24/07/97, p. 374-378.

1996:

  1. Conferences:
    1. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. DoToR - um sistema especialista para apoio ao diagnóstico diferencial de dor torácica. Anais do III Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde / Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, Campos do Jordão, SP, 13-17/10/96, p. 729-730.

1995:

  1. Conferences:
    1. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. A model of similarity-triggered analogical reasoning for diagnosis in medicine. Proceedings of 8th International Symposium on Systems - Modelling - Control, Zakopane, Poland, 01-05/05/1995, v. 2, p. 13-17.
    2. Lopes, H.S., Nassar, S.M., Pozo, A.R., Lima, W.C. Estimating membership functions using medical data. Proceedings of 6th International Fuzzy Systems Association World Congress - IFSA'95, São Paulo, SP, 22-28/07/1995, v. II, p. 289-292.
    3. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. Using genetic algorithms for qualitative improvement of clinical abilities. Proceedings of 6th International Fuzzy Systems Association World Congress - IFSA'95, São Paulo, SP, 22-28/07/1995, v. I, p. 161-164.

1994:

  1. Journal papers:
    1. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. Improving performance of a heart disease diagnostic system with genetic algorithms. Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering. Rio de Janeiro, RJ, 21-26/08/1994. Physics in Medicine & Biology (special issue), v. 39a, part I, p. 459, 1994.
    2. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. An analogical-based reasoning system for chest pain diagnosis. Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering. Rio de Janeiro, RJ, 21-26/08/1994. Physics in Medicine & Biology (special issue), v. 39a, part I, p. 461, 1994.
  2. Book chapters:
    1. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. An application of analogical reasoning to diagnostic tasks. In: Chen, J.G., Attia, F.G., Crabtree, D.L. (eds.), Expert Systems Applications and Artificial Intelligence. Gournay-sur-Marne, France: IITT International, p. 729-734, 1994. ISBN: 2-9076-6930-3.
  3. Conferences:
    1. Lopes, H.S., Nassar, S.M., Lima, W.C. Using fuzzy sets do model linguistic concepts in medical domain: a case study of obesity. Proceedings of International Congress on Medical Informatics, La Habana, Cuba, 08-11/11/1994, p. ?, 1994.
    2. Lopes, H.S., Coutinho, M.S., Lima, W.C. Uma aplicação de raciocínio analógico em diagnóstico. Anais da 46a Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência - SBPC. Vitória, ES, 17-22/07/1994, p. 131, 1994.

1993:

  1. Conferences:
    1. Lopes, H.S., Nassar, S.M., Ramirez, A.T., Lima, W.C., Barreto, J., Alves, A.R. Clasificación difusa de obesidad para anestesia. Anales del X Congreso Chileno de Ingenieria Eléctrica. Valdivia, Chile, 16-20/11/1993, p. I.31-I.35, 1993.
    2. Lopes, H.S., Nassar, S.M., Ramirez, A., Lima, W.C. Arquiteturas híbridas integrando paradigmas conexionistas e simbolistas. Anais do I Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente. Rio Claro, SP, 8-10/09/1993, p. 10-18, 1993.

1990:

  1. Journal papers:
    1. Netto, E.J., Brescianinni, E.A., Lopes, H.S. Um modelo de interação tecnológica escola-empresa. Revista Brasileira de Administração, v. 25, n. 1, jan/mar/90, p. 162-164, 1990.

1989:

  1. Journal papers:
    1. Lopes, H.S., Netto, E.J., Wang B. Central microprocessada para monitoração de fototerapia. Revista Brasileira de Engenharia, v. 6, n. 2, p. 248-255, 1989.
    2. Lopes, H.S., Netto, E.J., Wang B. Central microprocessada para monitoração de fototerapia. Tecnologia e Humanismo, v. 6, p.40-44,1989.
  2. Conferences:
    1. Lopes, H.S., Netto, E.J., Wang B. Microprocessor-based phototherapy monitoring station. Proceedings of the V Mediterranean Conference on Medical & Biological Engineering. Patras, Greece, 29/08-01/09/1989, p. 298-299, 1989.
    2. Netto, E.J., Brescianinni, E.A., Lopes, H.S. Um modelo de integração tecnológica escola-empresa. Anais do XIV Simpósio Nacional de Pesquisa de Administração em Ciência e Tecnologia. Curitiba, PR, 23-25/10/1989, p. 651-657, 1989.
    3. Netto, E.J., Brescianinni, E.A., Lopes, H.S. Programa de balcão de teses do CEFET-PR. Anais do Seminário Internacional Universidade-Empresa. Rio de Janeiro, RJ, 05-08/06/1989, p. 234-265, 1989.
  3. Other:
    1. Leal Júnior, J.P., Lopes, H.S. Controlador para máquina seccionadora de aglomerado. Anais do VIII Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia - CICTE. São Carlos, SP, 1989, p. 109, 1989.
    2. Urba, E., Lopes, H.S. Conversor CC-CA com baixa geração de harmônicas. Anais do VIII Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia - CICTE. São Carlos, SP, 1989, p. 78, 1989.

1988:

  1. Conferences:
    1. Lopes, H.S., Netto, E.J., Wang B. Central microprocessada para monitoração de fototerapia. Anales del V Congreso Argentino de Bioingenieria. San Miguel de Tucumán, Argentina, 13-15/10/1988, p. 37, 1988.

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